El Palacio de Gobierno Municipal es una construcción de corte vanguardista, edificado en el año de 1912, siendo presidente municipal don Francisco Villanueva. Originalmente era de una sola planta, en estilo Art deco con reminiscencias. En el año de 1970, es trasformado en un edificio de dos plantas con tendencias vanguardistas. Para 1994, se le dota de un portal hacia el frente y recupera su antigua fachada. En su interior se aprecian murales y relieves de gran calidad artística.
Dentro del palacio municipal sobre las escaleras se encuentra un conjunto escultórico que representa al genial Orozco. En el corredor de la segunda planta podemos observar un bosquejo de la historia de Zapotlan terminando en el recuerdo del sismo de 1985 pintado por Daniel Quiroz.